一項新的遺傳分析表明，美國典型培養物保藏中心（American Type Tissue Collection，ATCC）提供的U87MG細胞系版本已經不能再代表神經膠質瘤。
瑞典Uppsala大學的研究人員利用短串聯重復序列（STR）基因分型和基于芯片的基因表達譜技術，比較了ATCC的U87MG細胞系和Uppsala大學的U87MG細胞系，以及約五十年前用來開發該細胞系時使用的腫瘤樣本。它表明，ATCC的U87MG細胞系不是神經膠質瘤，而更接近于之前分析過的膠質母細胞瘤樣本。這項研究結果近日在線發表在《Science Translational Medicine》上。
文章通訊作者、Uppsala大學免疫學、遺傳學和病理學研究者BengtWestermark表示，“Uppsala大學的細胞系與原始腫瘤的基因相同，但是ATCC的U87MG細胞系的來源不明。我們不知道在這五十年間的哪個時間點發生了細胞系的混淆，ATCC的U87MG細胞系極有可能來自另一例人類神經膠質瘤。”
ATCC的U87MG細胞系可能是人類膠質母細胞瘤
細胞系的誤認和污染日益成為醫學研究中的問題，這促使Nature、美國癌癥研究學會（AACR）和其他出版者引入指南，要求研究人員利用DNA分析技術認證已發表研究中使用的細胞系。
Westermark和他的同事們對原始U87MG細胞系很熟悉，它是60年代在Uppsala大學建立的，他們擔心ATCC的U87MG細胞系的真偽。由于Uppsala大學仍保存有生成該細胞系的原始神經膠質瘤腫瘤樣本，研究小組能夠直接將來自Uppsala大學和ATCC的U87MG神經膠質瘤細胞系與原始腫瘤的基因和轉錄模式進行比較。
研究人員通過16個短串聯重復標記物(STR標記)對來自ATCC和Uppsala大學的U87MG細胞系進行基因分型研究，他們發現這兩個U87MG細胞系有12個短串聯重復標記物存在差異。研究人員進一步將研究范圍擴大到Uppsala大學的另外19個人類神經膠質瘤細胞系，發現了兩個基因上完全相同的細胞系，這種情況似乎是由污染引起的。雖然U87MG細胞系與其他神經膠質瘤細胞系相似，但來自ATCC的版本仍然存在不同，研究小組通過線粒體DNA檢測和基于芯片的表達譜分析證明了這種差異。后者的分析結果表明，ATCC的U87MG細胞系似乎是人類膠質母細胞瘤。
根據這些發現，研究人員建議使用
STR基因分型驗證過的神經膠質瘤細胞系，例如Human Glioma Cell Culture資源。Westermark等作者寫道，“我們建議在大腦腫瘤生物學研究中使用這些或類似的神經膠質瘤細胞系。研究人員應該在研究培養的膠質母細胞瘤細胞時，使用這類細胞系作為參考，使用驗證過的細胞系替換U87MG和其他經典細胞系。”
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參考文獻：Origin of the U87MG glioma cell line: Good news and bad news. Science Translational Medicine, DOI:10.1126/scitranslmed.aaf6853
